涛涛水势，终于被上万百姓疏通出去，水灾局面得到控制。可是百姓救出来，吃饭却成了大问题，房屋倒塌、牲畜被冲走，粮食颗粒无收，总不能让老百姓饿死？朱珪命令运城县令开仓放粮，再拿出府库中的银子赈灾，可是官府却拿不出一点儿粮食和银子。朱珪见此形势，把县令叫来，问道：“你为官一方，本应造福百姓，如今饥民遍地，形势紧迫，为何不放粮赈灾！”县令见躲不过，只好跪下请罪，照实说了：“小人有罪，本县的府库，早已经亏空多年，附近都是如此，这是多年的积弊，罪不再某任身上，现在根本就拿不出粮食呀。”
朱珪大怒，命令县令补齐亏空。县令东挪西借，但一时之间哪里凑得齐！即便他多么努力，还是离亏空数额相差甚远。朱珪只能表奏朝廷，把他抄家，缴出物质粮食用来赈灾。
毕沅作为山西布政司，这个职位专管一省的才赋和人事，掌管一省的钱粮财政大权，全省的救灾物质，正好也是毕沅负责，下面的府库亏空，毕沅也有很大责任。朱珪把运城县府亏空一事告知毕沅，询问是怎么回事。实际上，当时每个县里都有大量亏空，这已是山西官场众所周知的现状，只不过朱珪刚从京城来，不知情况。毕沅只好敷衍推脱，说是县令可能平时贪污，自己有所不知，一面从其他地方调集救援物质，配合朱珪救灾。