破虏军新设的卫一级编制，大多数将采取混编，比如一个卫下设的五个旅，可能是由两个骑兵旅和三个步兵旅组成，也可能是由三个骑兵旅和两个步兵旅组成，或者是其他的组合方式，当然也有完全由骑兵所组成的骑兵卫，以及完全由步兵所组成的步兵卫。
破虏军八大军团将变为十大军团，其中西域军团、西疆军团、草原军团、北庭军团和东蛮军团的名称没有改变，本土军团、近卫军团和西昌军团的名字将被取消，刘基以中华神兽的名字，命名了另外五个军团，分别是青龙军团、白虎军团、朱雀军团、玄武军团和麒麟军团。
按照刘基的规划，西域军团、西疆军团和青龙军团将驻守西域都护府的三十个州，其中西域军团和西疆军团都下设十个卫，每个卫都是由两个骑兵旅和三个步兵旅组成，青龙军团下设八个卫，每个卫则是由三个骑兵旅和两个步兵旅组成。
另外西域都护府的每个州还将组建若干个守备营，最终西域都护府三十个州的守备部队将达到一百四十万，这样一来，破虏军在整个西域都护府的总兵力，将高达七百万人，凭借西域军团、西疆军团、青龙军团以及三十个州的守备部队，足以应对来自大宛国、车师国和安息国的威胁。
西域军团的统帅为廉颇，西疆军团的统帅为薛仁贵，青龙军团的统帅为王翦。