8月底或9月初，光绪皇帝手拟朱笔谕条面交张荫桓，委派张前往日本驻华公使馆，与日使讨论中国拟派头等钦差驻日本，以及委派康有为赴日“坐探”日本的变法经验以供中国参考。显然光绪皇帝在继续参照日本改革经验的同时，有意进一步密切中日之间的外交关系，最终走向中日结盟对付俄国，至少凭借与日本的特殊关系保护中国自身的利益。
9月5日下午，王文韶、张荫桓抵达日本驻华公使馆，拜访林权助公使。张荫桓首先介绍道：汉首席军机大臣王文韶奉大清国皇帝之命，亲自带来皇帝谕旨访问贵官，故而本大臣亦与王文韶大臣同道而来。接着，张荫桓向林权助表述了三个意思：一是“最近以来，我国与贵国大加亲密，由此我大皇帝陛下欲使此亲交愈加密切。如今希望将头等第一勋章赠送给贵国大皇帝陛下，并命正在北上途中的新任公使黄遵宪将其携带至日本，奉呈贵国大皇帝陛下。”二是“此次黄遵宪携带的国书，其词句与以前同样奉呈者有所不同。此次国书上大改字句，以示亲交相依之御意。其文句已由皇帝亲自拟定。新国书以‘大清国大皇帝敬问我同洲至亲至近友邦诞膺天佑践万世一系帝祚之大日本大皇帝好’之字句开头。现敬请电询贵国政府，以此清国大皇帝之御意，转达于贵国皇帝陛下。”三是“想问贵政府之意向，清国皇帝有意向贵国派遣特命全权大使，不知贵国皇帝陛下是否有意受之？而且，贵国也向清国同样派大使。本件系以黄遵宪出发之期临近，我皇帝欲于事前得到贵政府的回答。这事亦请贵官以电报询问贵政府的意向。”